病理科是医院重要的医学诊断部门，病理诊断具有权威性，是疾病诊断的金标准。台州市中心医院病理科成立于2000年6月，经过20年发展，目前是台州市医、教、研一体化发展的大型临床病理中心。面积1000多平米，年常规工作量3.5万例，冰冻工作量4千余例，液基细胞学2万余例。学科人员21名，其中高级职称8名，博士研究生1名，硕士研究生6名，列入浙江省卫生创新人才1人，浙江省“151人才工程” 1人、台州市“211人才工程”第二层次2人，第三层次2人。

主要业务平台包括：常规病理学；细胞病理学；分子病理实验室；免疫病理实验室；感染病理实验室等。同时拥有：全国住院医师规范化培训基地，台州学院病理医学研究所，浙江省病理专科联盟理事单位，台州市卢洪胜名医工作室，生物样本库等科研教学平台。学科参与台州市省市共建学科、台州市重点支撑学科建设，是医院重点学科，同时，与美国匹兹堡大学医学中心、意大利安科纳联合大学医院、上海市第十人民医院、上海市肺科医院、浙江省肿瘤医院等建立了广泛的联系和合作，并与玉环市第二人民医院、温岭市第四人民医院、贵州万山区人民医院等建立帮扶关系。

学科承担省厅市级课题近20项，发表国内外学术论文近50篇，获省厅市级科研成果10余项，获得专利近10项，主持国家级继教项目1项，省级继教项目2项，参加国际学术大会并作大会交流及壁报展示各1次，出版著作（教材）2部。承担台州学院大学本科教学工作和住院医师规培任务。

近年来在学科建设方面取得较好成绩，服务量、业务总量明显增长，医疗质量令人满意。在浙江省病理质控检查中连续获得优秀，2014、2016、2017、2018、2019年连续获医院优秀团队称号。